基本信息
- 項目名稱:
- 楊梅Cu/Zn超氧化物歧化酶基因(MrSOD1)cDNA的克隆及表達分析
- 小類:
- 生命科學(xué)
- 簡介:
- 本研究以楊梅葉為材料,提取總RNA,根據(jù)植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端設(shè)計簡并引物,利用RT-PCR技術(shù),從楊梅葉中克隆到一個Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)編碼區(qū)全長cDNA序列。
- 詳細(xì)介紹:
- 本研究以楊梅葉為材料,提取總RNA,根據(jù)植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端設(shè)計簡并引物,利用RT-PCR技術(shù),從楊梅葉中克隆到一個Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)編碼區(qū)全長cDNA序列,長度為461 bp。該基因編碼一個由152 個氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)。楊梅MrSOD1具有Cu/Zn超氧化物歧化酶的特征信號序列GFHVHAlGDtT和GNAGgRvACgiI。序列同源性分析表明,楊梅MrSOD1與GenBank中注冊的SOD序列的同源性均在77%以上。蛋白疏水性分析顯示,楊梅MrSOD1具2 個明顯的跨膜區(qū)。半定量RT-PCR分析顯示,MrSOD1在楊梅葉、枝條、果和花4 種組織中均有表達,其表達量為果>葉>花>枝條,相對表達量分別為1.1489、0.2376、2.8714和1.0321。
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- 超氧化物歧化酶是植物體內(nèi)活性氧清除系統(tǒng)中的抗氧化酶,該酶在逆境脅迫下增強表達能夠提高植物清除活性氧的能力,增加植物的抗逆性。本項目旨在克隆楊梅超氧化物歧化酶基因,并分析該基因表達模式,為探索其調(diào)控途徑及楊梅抗氧化傷害的分子機理奠定基礎(chǔ)。
科學(xué)性、先進性及獨特之處
- 以楊梅為研究對象進行SOD基因與植物抗逆性關(guān)系的研究迄今尚未見報道。
應(yīng)用價值和現(xiàn)實意義
- 本研究旨在克隆楊梅超氧化物歧化酶基因(該基因命名為MrSOD1)的cDNA序列,為研究該基因時空表達特性,探索其調(diào)控途徑及楊梅抗氧化傷害的分子機理奠定基礎(chǔ)。
學(xué)術(shù)論文摘要
- 本研究以楊梅葉為材料,提取總RNA,根據(jù)植物Cu/Zn超氧化物歧化酶的5′和3′末端設(shè)計簡并引物,利用RT-PCR技術(shù),從楊梅葉中克隆到一個Cu/Zn超氧化物歧化酶基因MrSOD1(Genbank accession No. GQ404510)編碼區(qū)全長cDNA序列,長度為461 bp。該基因編碼一個由152 個氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)。楊梅MrSOD1具有Cu/Zn超氧化物歧化酶的特征信號序列GFHVHAlGDtT和GNAGgRvACgiI。序列同源性分析表明,楊梅MrSOD1與GenBank中注冊的SOD序列的同源性均在77%以上。蛋白疏水性分析顯示,楊梅MrSOD1具2 個明顯的跨膜區(qū)。半定量RT-PCR分析顯示,MrSOD1在楊梅葉、枝條、果和花4 種組織中均有表達,其表達量為果>葉>花>枝條,相對表達量分別為1.1489、0.2376、2.8714和1.0321。
獲獎情況
- 無
鑒定結(jié)果
- 無
參考文獻
- [1] McCord J M, Fridovich I. Superoxide dismutase. an enzymic function for erythrocuprein (hemocuprein)[J]. J. Biol. Chem., 1969,244(22):6049–6055. [2] Ma X J, Zhu D H. Functional roles of the plant superoxide dismutase[J]. Hereditas, 2003,25(2):225-231. [3] Kim E J, Kim H P, Hah Y C, et al. Differential expression of superoxide dismutases containing Ni and Fe/Zn in Streptomyces coelicotor[J]. Eur. J. Biochem., 1996,(241):178-185. [4] Tsang E W, Bowler C, Herouart D, et al. Differential regulation of superoxide dismutases in plants exposed to environmental stress[J]. Plant Cell, 1991,3(8):783-792. [5] Perl T R, Galun E. The tomato Cu, Zn superoxide dismutase genes are developmentally regulated and respond to light and stress[J]. Plant Mol. Biol., 1991,(17):745-760.
同類課題研究水平概述
- 自從第一個植物SOD基因從玉米中克隆以后,植物SOD基因的克隆在國外進展迅速。科研工作者主要從一些經(jīng)濟作物中得到SOD基因的cDNA序列或表達序列標(biāo)簽(expressed sequence tags,EST)。Fe-SOD基因也從水稻(Oryza sativa L.)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、白花丹葉煙草(Nicoliana plumbaginifolia)和樟樹(Cinnamomum camphora)等高等植物中得到克隆。Cu/Zn-SOD有較多的保守位點。這為同源PCR克隆策略提供了依據(jù)。 楊梅(Myrica rubra (Lour) Sieb. and Zucc.)是雙子葉綱楊梅科(Mycicaceae)楊梅屬(Myrica L.)常綠灌木或小喬木,是原產(chǎn)于中國的亞熱帶果樹之一。楊梅喜溫暖濕潤氣候,耐陰,喜排水良好的酸性土,微堿性土壤也能適應(yīng),深根性,萌芽力強。以楊梅為研究對象進行SOD基因與植物抗逆性關(guān)系的研究迄今尚未見報道。本研究旨在克隆楊梅超氧化物歧化酶基因(該基因命名為MrSOD1)的cDNA序列,為研究該基因時空表達特性,探索其調(diào)控途徑及楊梅抗氧化傷害的分子機理奠定基礎(chǔ)。