基本信息
- 項目名稱：
- 分子對接技術(shù)構(gòu)建TEAD與NF-κB P65亞單位的結(jié)構(gòu)模型
- 小類：
- 生命科學(xué)
- 簡介：
- 本實驗使用分子對接技術(shù)從TEAD與p65的單體結(jié)構(gòu)出發(fā)，建立其復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)模型，并分析兩蛋白相互作用方式。
- 詳細介紹：
- 本實驗使用對接軟件Zdock和RosettaDock從TEAD與p65的單體結(jié)構(gòu)出發(fā)，建立其復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)模型，并分析兩蛋白相互作用方式，并分析兩蛋白之間相互作用的關(guān)鍵氨基酸殘基，發(fā)現(xiàn)TEAD與p65相互作用部位關(guān)鍵氨基酸是THR324，TYR326，PHE329。
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- NF-κB是抗凋亡的重要轉(zhuǎn)錄因子，它的激活可以拮抗細胞凋亡。TEAD是一種轉(zhuǎn)錄增強因子，其與特異的共激活因子結(jié)合可以起始一系列下游靶基因表達。最近的研究發(fā)現(xiàn)NF-κB p65亞單位可與TEAD4發(fā)生相互作用。為了闡明NF-κB p65亞單位與TEAD4相互作用機制，本實驗使用分子對接技術(shù)從TEAD與p65的單體結(jié)構(gòu)出發(fā)，建立其復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)模型，并分析兩蛋白相互作用方式。
科學(xué)性、先進性及獨特之處
- 本作品所使用的對接軟件Zdock和RosettaDock都在應(yīng)用中取得了非常好的成績，對接結(jié)果可靠。使用分子對接的方法能方便的構(gòu)建TEAD與p65的三維結(jié)構(gòu)，解決了使用實驗方法測復(fù)合物結(jié)構(gòu)及其困難的問題。
應(yīng)用價值和現(xiàn)實意義
- 為后續(xù)研究NF-κB p65亞單位與TEAD4之間的相互作用提供了必要的理論支持和實驗方向，避免了實驗的盲目性。
學(xué)術(shù)論文摘要
- NF-κB是抗凋亡、促存活的重要轉(zhuǎn)錄因子，它的激活可以拮抗細胞凋亡。TEAD是一種轉(zhuǎn)錄增強因子，其與特異的共激活因子結(jié)合可以起始一系列下游靶基因表達。最近的研究發(fā)現(xiàn)NF-κB p65亞單位可與TEAD4發(fā)生相互作用，但兩者具體的作用部位和機制還尚不清楚。為了闡明NF-κB p65亞單位與TEAD4之間的相互作用的機制，本實驗使用分子對接技術(shù)，預(yù)測其TEAD與p65兩個蛋白復(fù)合體的三維結(jié)構(gòu)，并分析兩蛋白之間相互作用的關(guān)鍵氨基酸殘基，發(fā)現(xiàn)TEAD與p65相互作用部位關(guān)鍵氨基酸是THR324，TYR326，PHE329。
獲獎情況
- 無
鑒定結(jié)果
- 無
參考文獻
- 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)對接,TEAD,NF-κB,蛋白質(zhì)相互作用,p65
同類課題研究水平概述
- NF-κB p65亞單位可與TEAD相互作用的研究目前還處于起始階段，很多方面的理論還很不清楚，比如p65與TEAD相互作用可以引起的生理反應(yīng)，對細胞凋亡的影響，p65與TEAD復(fù)合物結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系等。我們的實驗為闡明TEAD與p65相互作用機理提供了一定的理論基礎(chǔ)，也對以后展現(xiàn)TEAD與p65相互作用的具體氨基酸提供了實驗方向。本實驗中得到的幾個關(guān)鍵氨基酸可作為定點突變的氨基酸來更加清楚的探究TEAD與p65相互作用的機制。
