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基本信息
- 項(xiàng)目名稱：
- A型流感病毒NS1蛋白抑制劑的虛擬篩選
- 小類：
- 生命科學(xué)
- 簡介：
- 本文以禽流感病毒N-端RNA結(jié)合域(RBD)為靶點(diǎn),以NCI 和Maybridge數(shù)據(jù)庫中20萬個小分子為篩選對象，建立了NS1抑制劑的虛擬篩選方法。經(jīng)過兩輪篩選(初步篩選與精細(xì)對接)確定出17個可能的先導(dǎo)化合物。
- 詳細(xì)介紹：
- 目前關(guān)于NS1A抑制劑的研究報導(dǎo)較少，僅有通過高通量篩選的方法篩選出幾個有活性的化合物分子。本文以禽流感病毒N-端RNA結(jié)合域(RBD)為靶點(diǎn),以NCI 和Maybridge數(shù)據(jù)庫中20萬個小分子為篩選對象，建立了NS1抑制劑的虛擬篩選方法。經(jīng)過兩輪篩選(初步篩選與精細(xì)對接)確定出17個可能的先導(dǎo)化合物，這些化合物的結(jié)構(gòu)基團(tuán)特性與已知抑制劑相似，對其結(jié)合模式進(jìn)行初步分析后發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物與NS1蛋白具有較強(qiáng)的親和力，能夠形成氫鍵等穩(wěn)定的相互作用力。本研究中所篩選出的NS1可能的先導(dǎo)化合物及其與NS1抑制劑結(jié)合模式的分析為新型NS1抑制劑的研究奠定了基礎(chǔ)。
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- 依賴于已建立的禽流感病毒NS1蛋白數(shù)據(jù)庫中的NS1蛋白資源，在省工程中心的高效計(jì)算機(jī)平臺上，以A型流感病毒NS1蛋白N端RBD結(jié)合口袋為靶點(diǎn), 以其虛擬篩選篩選NS1蛋白抑制劑的化合物。
科學(xué)性、先進(jìn)性及獨(dú)特之處
- 篩選出的NS1可能的抑制劑先導(dǎo)化合物評價較好，為新型NS1抑制劑的研究提供參考
應(yīng)用價值和現(xiàn)實(shí)意義
- 本研究基于分子對接配體受體相互作用的原理，以流感病毒NS1蛋白三維結(jié)構(gòu)兩功能位點(diǎn)為靶點(diǎn)，利用高性能計(jì)算機(jī)虛擬篩選的評價較高抑制劑分子，將建立一種全新的篩選抗流感病毒藥物的方法，將大大縮短新藥物的研發(fā)時間，節(jié)省大量的人力和物力。該方法將在遼寧省生物大分子計(jì)算模擬與信息處理工程研究中心轉(zhuǎn)化為科研成果，可以進(jìn)一步應(yīng)用于其他相關(guān)項(xiàng)目研究，該方法的推廣將產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)和社會效益。
學(xué)術(shù)論文摘要
- A型流感病毒是一種嚴(yán)重危害人類以及畜禽健康的致命性病毒，而且歷史上幾次流感大流行也都由A型流感病毒引起。A型流感病毒NS1蛋白是病毒的復(fù)制、傳播、發(fā)病機(jī)理非常依賴的蛋白，現(xiàn)已被證明是抗流感藥物作用的靶蛋白質(zhì)，尤其是N-端RNA結(jié)合域(RNA-binding domain,RBD)是抗流感藥物作用的一個潛在靶點(diǎn)。 本文以A型流感病毒NS1蛋白RBD結(jié)合口袋為靶點(diǎn), 以NCI 和Maybridge數(shù)據(jù)庫中的20萬個小分子為篩選對象，建立了NS1抑制劑的虛擬篩選方法。經(jīng)過兩輪篩選(初步篩選與精細(xì)對接)確定出17個可能的先導(dǎo)化合物，這些化合物的結(jié)構(gòu)基團(tuán)特性與已知抑制劑相似，對其結(jié)合模式進(jìn)行初步分析后發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物與NS1蛋白具有較強(qiáng)的親和力，能夠形成氫鍵等相互作用力，本研究中所篩選出的NS1可能的先導(dǎo)抑制劑化合物及其與受體結(jié)合模式的分析為新型NS1抑制劑的研究奠定了基礎(chǔ)。
獲獎情況
- 無
鑒定結(jié)果
- 無
參考文獻(xiàn)
- 1.Monto, A. S., and R. J. Whitley. Seasonal and pandemic in?uenza: a 2007 update on challenges and solutions. Clin. Infect. Dis, 2008.,46:1024–1031. 2.Dipanwita Basu, Marcin P. Walkiewicz, Matthew Frieman, et al.Novel In?uenza Virus NS1 Antagonists Block Replication and Restore Innate Immune Function.[J]. Jounal of Virology, 2009,83(4):1881-1891.
同類課題研究水平概述
- 現(xiàn)階段關(guān)于NS1A抑制劑的研究報導(dǎo)不多，其中以NS1ARBD為靶點(diǎn)的主要有Basu等[57]人建立了酵母篩選模型成功篩選出四個具有很高活性的化合物可以抑制A型流感病毒不同毒株的復(fù)制，此外Maroto等[58]也通過高通量篩選的方法發(fā)現(xiàn)了一些先導(dǎo)化合物，但資料未公開；這證明了NS1A作為藥物靶標(biāo)的合理性和有效性。
