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基本信息
- 項目名稱：
- 水產(chǎn)品中諾如病毒的檢測及其系統(tǒng)發(fā)育分析
- 小類：
- 生命科學(xué)
- 簡介：
- 本論文研究水產(chǎn)品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產(chǎn)品樣品和腹瀉病人糞便樣品進(jìn)行檢測，對陽性病毒蛋白進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進(jìn)化樹構(gòu)建等生物信息學(xué)方法，對檢出的陽性病毒進(jìn)行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測，3D同源建模為進(jìn)一步探索水產(chǎn)品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術(shù)依據(jù)。
- 詳細(xì)介紹：
- 本論文研究水產(chǎn)品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產(chǎn)品樣品和腹瀉病人糞便樣品進(jìn)行檢測，對陽性病毒蛋白進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進(jìn)化樹構(gòu)建等生物信息學(xué)方法，對檢出的陽性病毒進(jìn)行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測，3D同源建模為進(jìn)一步探索水產(chǎn)品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術(shù)依據(jù)。
作品專業(yè)信息
撰寫目的和基本思路
- 本研究以水產(chǎn)品中污染的諾如病毒為研究對象，研究諾如病毒靈敏、快速的分子檢測和高效的病毒濃縮方法，并對實際樣本中諾如病毒的污染狀況進(jìn)行調(diào)查，為進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查研究和大規(guī)模突發(fā)性疾病暴發(fā)時病因的溯源打下基礎(chǔ)。
科學(xué)性、先進(jìn)性及獨特之處
- 國內(nèi)外針對腹瀉性病人糞便樣品諾如病毒的檢測已有較深入的研究報道，但以水產(chǎn)品等傳播載體進(jìn)行探究的相關(guān)文獻(xiàn)報道相對較少。本研究主要針對水產(chǎn)品預(yù)處理（病毒濃縮）、諾如病毒快速檢測方法建立及其分子流行病學(xué)等開展研究與探索，首次對廈門及周邊地區(qū)的水產(chǎn)品中諾如病毒污染情況進(jìn)行了調(diào)查，并對檢測出陽性病毒菌株核酸進(jìn)行蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測及3D同源建模。
應(yīng)用價值和現(xiàn)實意義
- 諾如病毒是引起食源性病毒性腹瀉性疾病的重要病因之一。貝類等水生生物由于其濾過性攝食的特性，被認(rèn)為是諾如等食源性病毒傳播的高危載體。目前，尚無詳盡的相關(guān)病毒學(xué)標(biāo)準(zhǔn)用于諾如病毒的檢測。因此，建立便捷、可靠的諾如病毒檢測方法，就廈門及周邊地區(qū)的水產(chǎn)品進(jìn)行病毒污染情況調(diào)查，具有較好實際應(yīng)用價值和現(xiàn)實意義。
學(xué)術(shù)論文摘要
- 本論文研究水產(chǎn)品中諾如病毒的高效病毒濃縮、提取方法，建立諾如病毒RT-PCR檢測方法，對水產(chǎn)品樣品和腹瀉病人糞便樣品進(jìn)行檢測，對陽性病毒蛋白進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測并建立同源模型。通過借助BLASTX比對、進(jìn)化樹構(gòu)建等生物信息學(xué)方法，對檢出的陽性病毒進(jìn)行型別鑒定與系統(tǒng)發(fā)育分析，蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測，3D同源建模為進(jìn)一步探索水產(chǎn)品中諾如病毒流行規(guī)律和流行因素，制訂諾如病毒引起的食源性疾病防控對策提供技術(shù)依據(jù)。
獲獎情況
- 獲第五屆“挑戰(zhàn)杯”集美大學(xué)學(xué)生課外學(xué)術(shù)科技作品競賽自然科學(xué)類三等獎
鑒定結(jié)果
- 無
參考文獻(xiàn)
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同類課題研究水平概述
- 近年來世界范圍內(nèi)相繼報道多起食物因污染Nov病毒導(dǎo)致急性胃腸炎的暴發(fā)和散發(fā)，引起了各國政府和科學(xué)工作者的重視。目前，諾如病毒的診斷方法主要有直接電鏡法、免疫電鏡法(IEM)、放射免疫法(RIA)、酶免疫分析法(EIA)、RT-PCR等。由于諾如病毒目前無法進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)，而且在水產(chǎn)品中諾如病毒含量一般較低，檢測有一定難度。近30年來隨著檢測手段的發(fā)展和調(diào)查研究的深入，檢測技術(shù)有較大的突破，例如，Herrmann等建立了用甘氨酸緩沖液從海產(chǎn)品組織中直接洗提病毒的方法;張穎等人應(yīng)用RT-PCR方法檢測貝類中諾如樣病毒的研究；Green李暉等將巢式RT-PCR方法應(yīng)用到貝類樣品諾如病毒檢測中, 其靈敏度比單輪RT-PCR方法提高了10-1000倍；Myrmel等利用熒光定量RT-PCR和熒光定量nested RT-PCR對挪威海岸水產(chǎn)品中腸道病毒進(jìn)行了檢測分析，貝類樣品諾如病毒檢出率為6. 8%, 冬季更高；潘良文等建立了從貝類中提取諾如病毒的RNA并進(jìn)行實時熒光RT-PCR檢測方法；蘇來金等初步建立了貝類中諾如病毒SYBR Green I實時定量RT-PCR檢測方法，比常規(guī)RT-PCR方法敏感100倍，并對所檢測到的貝類中陽性株核酸片段進(jìn)行克隆、轉(zhuǎn)化、序列分析和同源比對，顯示5份諾如病毒陽性株均為GGII型，與國內(nèi)報道的GII型毒株同源性達(dá)到98%以上；汪俊等對太平洋牡蠣中諾如病毒檢出的2株陽性樣品進(jìn)行了序列分析，表明貝類中諾如病毒與腸胃炎病人糞便中諾如病毒的高同源性。諾如病毒在自然界中的宿主、
